La organización de la Policía Nacional se estructura en tres niveles jerárquicos: el nivel central, el nivel territorial y el nivel local.

A nivel central, se encuentra la Dirección General de la Policía, que es el órgano superior de la Policía Nacional y está encargado de la dirección y coordinación de todas las unidades y servicios de la institución. Entre las funciones de la Dirección General se encuentran la planificación, coordinación, dirección y control de las actuaciones de la Policía Nacional en todo el territorio nacional. La Dirección General de la Policía está compuesta por distintas divisiones y servicios, como son la División de Coordinación y Estudios, la División de Formación y Perfeccionamiento o el Servicio de Asuntos Internos.

A nivel territorial, se encuentran las Comisarías Generales, que son los órganos encargados de la dirección y coordinación de las distintas áreas de la Policía Nacional. Entre ellas se encuentran la Comisaría General de Seguridad Ciudadana, la Comisaría General de Policía Judicial o la Comisaría General de Extranjería y Fronteras. Cada una de estas comisarías está a cargo de un comisario general, que es el responsable de coordinar y dirigir las distintas unidades y servicios que dependen de ellas.

A nivel local, se encuentran las Comisarías Provinciales, que son las unidades encargadas de la dirección y coordinación de la Policía Nacional en cada una de las provincias españolas. Cada Comisaría Provincial está a cargo de un comisario jefe, que es el responsable de coordinar y dirigir las distintas unidades y servicios que dependen de ella.

Las unidades operativas de la Policía Nacional son las encargadas de llevar a cabo las misiones y funciones asignadas a la Policía Nacional. Entre ellas se encuentran la Brigada Provincial de Seguridad Ciudadana, la Brigada Provincial de Policía Judicial o la Unidad de Prevención y Reacción. Estas unidades están compuestas por agentes de policía, que pueden desempeñar distintas funciones en función de su especialización y formación.

La Policía Nacional dispone de una amplia y variada información sobre delitos, infracciones y personas investigadas. Para su gestión, la Policía Nacional cuenta con distintas bases de datos, como el Sistema de Información Schengen (SIS), que contiene información sobre personas buscadas por delitos y personas objeto de medidas restrictivas, o el Sistema de Información de Antecedentes Penales (SIAP), que contiene información sobre antecedentes penales y policiales.

Además, la Policía Nacional también puede acceder a bases de datos compartidas con otras instituciones, como el Ministerio del Interior o el Servicio de Vigilancia Aduanera. La gestión de esta información se realiza de forma estrictamente regulada por la Ley de Protección de Datos y la Ley de Enjuiciamiento Criminal, entre otras normativas.